Vzhľadom na vysokú hustotu výpočtového výkonu je systém chladenia navrhnutý ako vodný, redundantný a plne automatizovaný.
Primárne médium tvorí zmes vody a glykolu, ktorá zabezpečuje optimálny odvod tepla aj v náročných prevádzkových podmienkach.
Vo vonkajších priestoroch Superpočítačového centra sú umiestnené tri chladiace jednotky (Chillery) značky STULZ, pracujúce v automatickom redundantnom režime.
Chladenie je rozdelené do dvoch okruhov:
- Okruh studenej vody – chladí medzirackové jednotky HPE ARC, ktoré odvádzajú teplo priamo z rackov,
- Okruh teplej vody – prostredníctvom výmenníkov tepla, zmiešavačov a rozvodných manifoldov distribuuje chladenie do univerzálnej výpočtovej partície a akcelerovanej GPU partície.
Tento systém umožňuje presné riadenie tepelnej rovnováhy a maximalizuje energetickú efektivitu chladenia.